به گزارش مفدا تبریز، این کارگاه با هدف آشنایی دانشجویان با تکنولوژی توالی یابی NGS و آموزش عملی آنالیز داده های خام NGS برگزار گردید.

کارگاه در ۴ جلسه برگزار شده و بصورت سلسله وار از مقدمه ای بر NGS تا معرفی ابزارهای بیوانفورماتیکی لازم برای تحلیل داده ها ونیز نحوه تحلیل داده ها برگزار شد.

دانشجویان و فعالین حوزه سلامت و محققان علاقه مند به NGS و آنالیز داده ها مخاطب این برنامه بودند و تعداد ۱۸ نفر به صورت حضوری و ۸ نفر آنلاین شرکت ئاشتند.

مدرسین برنامه:
دکتر محسن رشید: هیئت علمی گروه پزشکی مولکولی دانشکده علوم نوین پزشکی دانشگاه علوم پزشکی تبریز
دکتر محمد رضا صادقی: هیئت علمی گروه پزشکی مولکولی دانشکده علوم نوین پزشکی دانشگاه علوم پزشکی تبریز
دکتر علی عاقبتی ملکی: هیئت علمی گروه پزشکی مولکولی دانشکده علوم نوین پزشکی دانشگاه علوم پزشکی تبریز

در جلسه اول دکتر محمد رضا صادقی به توضیح کاربردهای مختلف تکنیک NGS با مثالهای عملی پرداختند. از جمله مباحث مطرح شده توسط ایشان موارد زیر می باشند: تعریف واژه NGS، مقایسه روش های توالی یابی، روند فرآیند NGS، پلتفرم های موجود، انواع روشهای توال یابی توسط NGS، نقش تکنیک NGS در بیماریهای ژنتیکی، انواع تغییرات ژنتیکی قابل شناسایی توسط NGSف مثالهایی از کاربردهای کلینیکی NGS در انواع بیماریها، توضیحات بار جهشی تومور، کاربرد NGS در بیماری های عفونی، چالش های کلینیکی
در جلسه دوم، دکتر علی عاقبتی ملکی، به اهمیت NGS و کاربرد آن در P۷ Medicine پرداخته و مرکز تحقیقات نقص ایمنی و ارتباط آن با خدمات NGS را بیان نموده و نیز انواع تست های بر پایه NGS را تشریح کردند.
در جلسه سوم، چهارم و پنجم دکتر رشید مطالب زیر را بصورت عملی با دانشجویان در میان گذاشته و اجرا نمودند: معرفی سایت های مرجع داده های NGS، نحوه جستجوی داده های NGS و نرم افزارهای لازم جهت آنالیز داده ها، بررسی کیفی داده های توسط نرم افزار FastQ، نحوه trimming توالی ها توسط نرم افزار TrimmomaticT، نحوه نصب نرم افزارهای مورد نیاز، نحوه ارزیابی داده ها، trimming داده ها و بررسی کیفی آنها